Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms