Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn8Q9Z260 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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