Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ilf3Q9Z1X4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ilf3Q9Z1X4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ilf3Q9Z1X4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms