Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Snx1Q9WV80 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx1Q9WV80 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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