Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms