Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trpc2Q9R244 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trpc2Q9R244 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trpc2Q9R244 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trpc2Q9R244 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trpc2Q9R244 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trpc2Q9R244 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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