Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psma4Q9R1P0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psma4Q9R1P0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms