Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav3Q9R0C8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms