Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gpc6Q9R087 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc6Q9R087 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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