Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms