Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim44Q9QXA7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms