Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdcQ9QW08 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdcQ9QW08 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms