Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms