Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd1aQ9JLR9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms