Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms