Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms