Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tuba8Q9JJZ2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tuba8Q9JJZ2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms