Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra4Q9JJT2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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