Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trappc4Q9ES56 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms