Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clstn2Q9ER65 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms