Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Swt1Q9DBQ9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Swt1Q9DBQ9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms