Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Erp27Q9D8U3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms