Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gtf3c6Q9D8P7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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