Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms