Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt20Q9D312 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms