Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Trappc6bQ9D289 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Trappc6bQ9D289 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Trappc6bQ9D289 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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