Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Mrpl28Q9D1B9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms