Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ss18l2Q9D174 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms