Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms