Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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