Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NsmfQ99NF2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms