Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q99M08 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q99M08 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q99M08 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q99M08 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q99M08 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms