Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q99KU6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q99KU6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q99KU6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q99KU6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q99KU6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q99KU6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q99KU6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q99KU6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms