Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krcc1Q99JT5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krcc1Q99JT5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms