Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ddb2Q99J79 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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