Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb6Q922F4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms