Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pth2Q91W27 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pth2Q91W27 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms