Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc8Q8VD72 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms