Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zcchc18Q8VD24 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms