Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgms1Q8VCQ6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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