Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms