Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf628Q8CJ78 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms