Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hpf1Q8CFE2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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