Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup88Q8CEC0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup88Q8CEC0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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