Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrebrfQ8CDG5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms