Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf31Q8CCF0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf31Q8CCF0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms