Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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