Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Pggt1bQ8BUY9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pggt1bQ8BUY9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms