Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms