Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdca8Q8BHX3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms